中國農業大學研究生院設立于1984年，是教育部首批批準設立研究生院的院校之一。研究生院院長由副校長辛賢教授兼任，常務副院長為李健強教授，研工部部長兼副院長為郭鑫教授。研究生院下設綜合辦公室、管理處、招生辦公室、培養處、學位辦公室五個處室。黨委研究生工作部與管理處合署辦公；中國農業大學研究生教育創新研究中心掛靠研究生院。
我校研究生院現有20個博士學位授權一級學科，碩士學位授權一級學科29個，95個博士學位授權點，144個碩士學位授權點，9個碩士專業學位類型及專業學位領域33個；擁有12個國家級重點學科，19個部級重點學科，15個博士后流動站。其中植物保護、作物學、畜牧學、獸醫學、食品科學與工程、農業資源與利用、農業工程等一級學科在近年的一級學科整體水平評估中排名全國第一，已經形成了包括碩士、博士和專業學位教育的較完善的研究生教育教學與管理體系，并且對全國農科研究生教育事業的發展起到了示范作用。目前，在學各類研究生約10000人，其中全日制在校研究生約8000人。